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染色体自动识别图像分析系统
国联在线M99系列医学图象工作站之染色体自动识别,使当前发展比较迅速的细胞遗传学实验室技术与计算机先进的自动识别技术相结合,为简化实验室烦琐操作而研制的新一代染色体自动识别系统。它避免了人工摄影、冲洗、放大、剪切等繁杂的人工配对工作,实现了染色体核型分析的自动化、智能化。染色体自动识别系统操作方便,识别率高,是一套先进的诊断、教学工具。
一. 硬件配套设备:
- C型接口三目显微镜,可以接入CCD视频采集设备。
- 视频采集设备CCD,数码相机等。
- 视频传输线:复合视频线,同轴电缆。
- 带RS232接口的计算机。
- 视频采集卡,安装在计算机的PCI插槽。
- SenseLock USB软件加密锁。
- 彩色喷墨打印机。
二. 软件运行环境:
- Windows 2000,Windows XP以上版本简体中文操作系统。
- 单机版文件数据库:Microsoft Access 2000及以上版本,Microsoft
SQL Server 2000网络版数据库及以上版本。
- 正确安装采集卡驱动,加密锁驱动。
三. 工作流程:
- 显微镜下图像,经过CCD视频采集,视频信号通过视频线,输入视频采集卡,系统软件通过视频采集驱动程序,将动态视频实时显示在计算机的显示器上。
- 建立检验报告。
- 冻结视频图像,采集典型染色体分裂相图像,存入报告中。
- 根据分裂相图像,结合镜下图像,进行染色体核型分析(自动和手动两种方式)和FISH(染色体荧光原位杂交)图像合成。
- 编辑报告,填写必要的检验数据。
- 将报告存入数据库中。
- 设置报告格式,打印完整的彩色图文报告。
四. 主要功能:
- 支持同时建立多个数据库,每个数据库中的报告数量,只受计算机硬盘容量限制。
- 可以对每个数据库设置口令。
- 可以根据报告日期、报告数据项查询报告。
- 查询结果可以存为报表,方便用户生成日报和月报等报表,或工作量统计表。
- 在每个报告中可以存入的典型图像,没有幅数限制。
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可以对图像进行多种方式的编辑,如灰化,反色,镜像,锐化,平滑,放大,10多种滤镜,可以调节红绿蓝色彩比例,可以调节色调饱和度亮度对比度,可以对红绿蓝通道进行曲线调节。
- 对每步图像编辑进行了记忆,可以撤销或恢复图像编辑操作。
- 可以在每幅图像上加入多个标注。标注方式含文字和图形。
- 编辑报告时,回车即可切换输入焦点,方便操作者快速录入。
- 图像可以存为BMP格式,以及GIF和JPG压缩图像格式。图像质量参数可调。
- 视频质量参数如色调、饱和度、亮度、对比度等参数可调。
- 在自动识别染色体后,可以方便地进行粘连和重叠染色体的分割:点击一次鼠标,即可完成。
- 对于特殊的粘连和重叠染色体,可以用手工画线的方式,完成分割。
- 可以拾取未能自动识别的染色体,可以手动修剪染色体轮廓边界。
- 可以去除染色体分裂相图像的背景和杂质。
- 可以设置某个染色体为异常染色体,在检验报告中,打印在核型图下方。
- 可以显示带纹数据,可以将核型与标准模式图进行对照。
- 可以全自动核型配对,对错误的配对,可以通过拖动鼠标进行修改。
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染色体在原始图像(分裂相图像)和核型图像中的位置,可以一一对应,在核型图中点击某个染色体,其在原始图像中的染色体边界,会出现“流动”现象。
- 可对染色体进行拉直和旋转操作。
- 支持三种ISCN标准模式图:ISCN400,ISCN550,ISCN800。
- 可以自定义模式图:增加带,删除带,修改带名称,设置长断臂、着丝粒位置等。
- 在FISH合成时,可以对参与合成的每幅图像,进行编辑,每个编辑操作都可以撤销或恢复。
- 在FISH合成时,可以调节全部或部分图像的背景阈值,调节色彩亮度,设置伪彩(如DAPI),将颜色纯化,可以舍弃某个颜色分量。
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FISH合成后,可以上下左右微调图像的相对位置,可以加入图形和文字标注。可以将FISH合成图到处为独立的图像文件。
FISH功能简介
- 各种颜色荧光图像采集,无限种颜色添加与修正,无限种颜色信号与图像合成。
- 图像捕获时可自动或手动调节曝光时间,放大并捕捉弱荧光信号。
- 增强荧光信号,去除背景杂质。
- 自动进行荧光信号计数。
- 自动或手动测量长度与面积等参数。
- 各种注释。
- 图像和文字资料储存于专业图像数据中。
- 灵活设置的分析报告内容和格式。
- 各种储存数据的快速检索。
- 可以迅速地获得探针的精确定位和信号的强度。
- 灵活的图像拍摄程序、控制曝光。
- 系统对图像每个RGB通道的亮度、对比度都可单独显示并调整。
- 背景均化和颜色信号增强工具操作简便,可以完成复杂的实时和互动功能。
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